张明教授的项目《癌控e+创业先锋：机器学习驱动的抗乳腺癌ssDNA适配体的虚拟筛选凭条》申报立项了2025年度大学生创新训练计划项目。
项目摘要：乳腺癌是全球女性健康的重大威胁，现有检测手段存在局限性，难以满足快速筛查的诊疗需求。Single-stranded DNA (ssDNA)适配体能够通过构象变化与靶标高亲和力和特异性地结合。因此，适配体特异性检验将成为解决问题的有效手段，但由于目前实验筛选的整体效率偏低而导致可用适配体数量较少。本研究拟对抗乳腺癌的ssDNA适配体进行了虚拟筛选、分析评价和实验验证。主要步骤包括：⑴数据筛选和数据集的准备；⑵数据集的查重和去冗余；⑶伪K元核苷酸组成及特征提取；⑷预测模型的构建及性能评估；⑸数据调整与模型优化；⑹虚拟筛选与验证；⑺分子对接与分子动力学模拟；⑻斑点印迹实验验证；⑼建立虚拟预测服务器。本研究将为靶向乳腺癌细胞及其标志物的ssDNA共抗适配体筛选提供有效的技术手段。
