张明教授的项目《食源性致病菌及外毒素共抗适配的虚拟筛选及验证研究》申报立项2025年度硕士建设学科科研能力提升重点项目。
项目摘要：沙门氏菌、大肠埃希氏菌O157：H7和金黄色葡萄球菌及外毒素是引起人类食物中毒最主要的原因，传统检测法因耗时较长而无法实现快速检测。Single-stranded DNA (ssDNA) 适配体能够通过构象变化与靶标高亲和力和特异性地结合。因此，ssDNA适配体检验将成为解决问题的有效手段，但由于目前实验筛选整体效率偏低而导致目前适配体数量较少。本研究基于机器学习和分子对接技术对致病菌及外毒素ssDNA共同适配体进行了虚拟筛选、分析评价和实验验证。主要步骤包括：⑴数据筛选和数据集的准备；⑵数据集的查重和去冗余；⑶伪K元核苷酸组成及特征提取；⑷预测模型的构建及性能评估；⑸数据调整与模型优化；⑹虚拟筛选与计算验证；⑺分子对接与打分评价；⑻斑点印迹实验验证；⑼建立虚拟预测服务器。本研究将为抗食源性致病菌及外毒素ssDNA共同适配体的筛选提供有效的技术手段。
